Главная

Проект Pneumococcal African Genome (PAGe) является консорциумом, финансируемым Фондом Билла и Мелинды Гейтс, ориентированным на геномный анализ пневмококка по всей Африке. Его цели включают в себя:

1. Создание потенциала в области биоинформатики и молекулярной эпидемиологии
2. Понимание эпидемиологии специфических пневмококковых серотипов
3. Выявление новых возможностей для борьбы с болезнями с помощью современных вакцин
4. Предоставление знаний для создания нового поколения пневмококковых вакцин

Источник: Библиотека Wellcome, Лондон

Проект осуществляется под руководством д-ра Дина Эверетта в Малави-Ливерпуль-Wellcome Trust программы клинических исследований (MLW) в Малави и включает в себя основных партнеров в Нигере, Гамбии, южной Африке, Великобритании и США.

Обзор исследований

PAGe 1

В качестве первого проекта Консорциум Пейдж сосредоточил свое внимание на серотипе Streptococcus pneumoniae 1, поскольку он является одной из основных причин опасных для жизни пневмококковых заболеваний в странах Африки к югу от Сахары и является важной целью вакцинации. Он проявляет сильную связь с инвазивными заболеваниями и может возникать во время вспышек или эпидемий. Понимание генетических признаков, которые лежат в основе этой ассоциации и способствуют ее эпидемический потенциал поможет уточнить вакцины целевого открытия и направлять процесс развития. Этот африканский консорциум будет рассматривать следующие конкретные вопросы:

1. Определите геномное разнообразие штаммов серотипа 1 и установите относительный вклад изменения последовательности, содержания генов и организации генома в это разнообразие
2. Установить связь этого разнообразия с клинической презентацией, эпидемическим потенциалом, болезнями и перевозками, а также установить, связаны ли эпидемические, болезни и характеристики перевозки (такие как пневмония, бактериемия или менингит) с конкретными генами или линиями.
3. Установить степень регионального серотипа 1 временных и географических различий. Эти данные будут использованы для уточнения и повышения эффективности пневмококковой конъюгной вакцины (PCV) в будущем.

Создание потенциала

Четыре аспиранта из стран-членов консорциума были профинансированы для завершения обучения биоинформатике MSc в Манчестерском университете, включая проектную работу в Институте Wellcome Trust Sanger Institute.